Biomedical information processing Team

The main objective includes search, indexing and relevant information retrieval in several areas: biological data (genome and gene expression), health information systems (health terminology, computerized medical record).

• Structural indexing
• Automated indexing
• Algorithm and information search

• Biology (sequence of the human genome)
• Health (non-structured textual data)

• PullCoVapart, ANR, 2020-2021
• SingleC, RIN et FEDER, 2018-2021
• ALENOR, RIN, 2018-2021

Collaborations Internationales

• King's College London (UK), algorithmique du texte
• Université de Catane (Italie), algorithmique du texte
• Université de Palerme (Italie), algorithmique du texte
• Université Nationale de Seoul (Corée du Sud), algorithmique du texte

Collaborations nationales

• LIMICS, informatique médicale
• CRIStAL (équipe BONSAI), algorithmique du texte, bioinformatique
• IRISA (équipe GenScale), algorithmique du texte, bioinformatique
• LIRMM (équipe MAB), algorithmique du texte

Collaborations locales

• DC2N, microARN, protéomique
• GlycoMEV, transcriptomique
• GREYC, algorithmique
• LMRS, biostatistiques
• PANTHER, single cell
• U1245, génomique et transcriptomique

Partenaires industriels

• OmicX, bioinformatique
• BioMérieux, ontologies médicales

Réseaux d’Intérêts Normands (RIN)

• Normandie Digitale
• Normandie Biomédicale et Chimie

Autres réseaux

• Pôle Sciences du Numérique
• NormaSTIC
• IRIB
• groupe de travail SeqBIM GDR BIM et IM du CNRS
• Commission Scientifique Spécialisée CSS6 : ≪ e-santé, Techno santé, santé pub. ≫

• PERMANENTS : 11
• DOCTORANTS : 2
• ASSOCIES : 1